1. vmd 로 검색하여 웹사이트 접속
2. 운영체제에 맞는 vmd로 다운로드
-다운로드를 위해 사용자 등록이 필요합니다.
-사용자 등록이 귀찮다면 당분간은 클러스터 node0의 /tmp/에 64비트과 32비트 리눅스용을    가져다 놓을테니 옮겨가세요. 설치하는 운영체제에 맞게 선택하시면 됩니다.
3. root 권한이 있을때 설치하는 법은 간단합니다.
-압축을 풀면 vmd-1.8.6이라는 디렉토리가 생깁니다.
$cd vmd-1.8.6
README파일에 설치 방법이 나와 있지만..
$./configure
$cd src
$make install
끝! 이미 /usr/local/bin이 PATH변수로 지정되어 있으므로 아무데서나
$vmd
하면 실행할 수 있습니다.
4. 단지 user권한만 있을때는
-압축을 풀고 vmd-1.8.6 디렉토리에 들어가기 전에 vmd의 실행파일을 둘 디렉토리를 만듭니다.
$mkdir ~/vmd
(~/표시는 자신의 홈디렉토리를 말합니다. pwd 해보세요, 현재 위치의 full path를 볼수 있습니다.)
$cd ~/vmd
$mkdir bin
다시 압축을 풀어놓은 vmd-1.8.6으로 가서,
$vi configure
configure파일을 편집합니다. 라인16에서,
$install_bin_dir="/home/dauni3/vmd/bin";
라인 19에서,
$install_library_dir="/home/dauni3/vmd";
로 바꾸고 저장합니다. 여기서 dauni3는 자신의 id로 바꿔야겠지요.
이제,
$./configure
$cd src
$make install
설치가 되었습니다. 그러나 편리하게 사용하기 위해서는 .bashrc파일에서 PATH변수에 ~/vmd/bin을 추가해야 합니다.